ΑΛΥΣΙΔΩΤΗ ΑΝΤΙΔΡΑΣΗ
ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗΣ (POLYMERASE
CHAIN REACTION, PCR)
ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗΣ (POLYMERASE
CHAIN REACTION, PCR)
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΠΡΑΚΤΙΚΗ ΙI
ΒΑΣΙΚΕΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ
- Η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης αποτελεί το δεύτερο βασικό βήμα για την μετέπειτα μελέτη του DNA και την γονοτύπηση.
- Το πρωτόκολλο της παρούσας εργαστηριακής άσκησης είναι απόλυτα προσαρμοσμένο για την πραγματοποίηση του από μαθητές και στο πλαίσιο του σχολικού περιβάλλοντος.
- Όλα τα υλικά που χρησιμοποιούνται κατά τη διάρκεια της άσκησης είναι πλήρως ασφαλή για χρήση αυτών από μαθητές και στο πλαίσιο του σχολικού περιβάλλοντος.
- Μέση διάρκεια της εργαστηριακής άσκησης «Αλυσιδωτή Αντίδραση Πολυμεράσης, PCR» είναι 1h και 30min.
- Τονίζεται η σημασία της γενετικής ανάλυσης και οι βιοηθικές προεκτάσεις αυτής.
- Τονίζεται η σημασία της λεπτομέρειας κατά τη μετάγγιση των μικροποσοτήτων για μία επιτυχημένη αντίδραση PCR ενισχυμένου σήματος και αποφυγής επιμόλυνσης με ενίσχυση ξένου DNA.
- Τονίζεται η σημασία του αρνητικού μάρτυρα και σε τι διαφέρει από ένα προς ανάλυση δείγμα ενδιαφέροντος.
Προετοιμασία εργαστηριακής άσκησης
- Πιπέπες Pasteur/πιπέτες ρυθμιζόμενου όγκου τύπου Gilson
- Φυγόκεντρος
- Συσκευή PCR
- Αυτοπωματιζόμενα σωληνάρια τύπου Eppendorf 0,5ml και 1,5ml
- Ακρορύγχια κατάλληλα για τις πιπέτες ρυθμιζόμενου όγκου διαφορετικού εύρους
- Η2Ο
- Θερμοανθεκτική Taq πολυμεράση
- Ρυθμιστικό διάλυμα (παρουσία MgCL2)
- dNTPs (δεοξυριβονουκλεοτίδια)
- Ευθύς και αντίστροφος εκκινητής
- DNA εκμαγείο προς ενίσχυση και μελέτη
Εργαστηριακή πορεία
- Προσθήκη όλων των αντιδραστηρίων του πρωτοκόλλου PCR με τη σειρά που αναγράφονται
- Προετοιμασία δύο δειγμάτων (*δείγμα XX, αρνητικός μάρτυρας XX)
- Καλή ανάμιξη των αντιδραστηρίων κατά την προετοιμασία του εκάστοτε δείγματος
- Φυγοκέντρηση δευτερολέπτων
- Τοποθέτηση του δείγματος 1 και του αρνητικού μάρτυρα 1 στην πλάκα της συσκευής PCR
- Εφαρμογή του προτεινόμενου θερμοκρασιακού πρωτοκόλλου
- Αναμονή μέχρι την προγραμματισμένη λήξη της λειτουργίας του μηχανήματος PCR
*Όπου XX ο μαθητής αναγράφει τα αρχικά του ονόματός του
Ερωτήσεις
- Γιατί είναι απαραίτητη η αναγραφή των ονομάτων σε αυτό το βήμα;
- Ποιος ο ρόλος του κάθε αντιδραστηρίου;
- Αν προσθέσω λίγο παραπάνω από τον κάθε εκκινητή ποια μπορεί να είναι τα πιθανά αποτελέσματα της αντίδρασης;
- Ποιος ο ρόλος του αρνητικού μάρτυρα;

